准备工作
设备校准:在开始测序之前,需要对基因测序仪进行校准,确保其性能符合标准。
样本准备:
DNA提取:从生物样本(如血液、组织等)中提取DNA。
文库构建:将提取的DNA打断成小片段,然后进行末端修复、加A尾、接头连接等步骤,构建成适合测序的文库。
样本质量控制:对构建好的文库进行定量和质控,确保文库的质量。
测序步骤
上机测序:
将合格的文库样本添加到测序反应体系中。
将反应体系加载到测序仪的样本板(或芯片)上。
测序反应:
PCR扩增:对文库样本进行PCR扩增,以增加目标区域的DNA量。
测序:测序仪会逐个读取DNA片段的序列信息。
测序仪会按照预定的测序流程进行反应,通常包括以下步骤:
数据收集:
测序仪会将测序结果以图像或数据流的形式输出。
数据分析:
质量控制:去除低质量序列。
序列拼接:将测序得到的短读段拼接成长序列。
比对:将拼接后的序列与参考基因组比对,确定变异位点。
变异注释:对检测到的变异进行功能注释。
将测序数据导入生物信息学软件进行分析,包括:
后续操作
结果解读:根据数据分析结果,解读测序数据,得出生物学结论。
报告生成:将分析结果整理成报告,供临床或研究使用。
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